创新酶切法试剂盒:打造高效建库,消除假阳性!-技术前沿-资讯-生物在线

创新酶切法试剂盒:打造高效建库,消除假阳性!

作者:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 2024-05-07T00:00 (访问量:37438)

NGS,即下一代测序技术,是近年来基因测序领域的一次重大突破。相较于传统的测序方法,NGS具有高通量、高准确性、低成本等诸多优势,使得基因测序变得更加高效和便捷。通过NGS技术,科学家们能够更深入地了解基因组的结构和功能,为疾病诊断、治疗以及新药研发等领域提供了强有力的支持。

 

 

酶切法建库:NGS的得力助手

在NGS的研究中,建库是一个至关重要的环节。建库的质量直接影响到测序结果的准确性和可靠性。而酶切法建库,避免了传统的机械打断,无需打断仪,流程简便,可同时处理多个样,更适合于自动化建库,满足大规模基因组研究的需求,是目前应用最广泛的建库方法之一。

酶切法建库有其独特的优势,但是也有其劣势,比如:酶切偏好性、引入假阳性、起始量适用范围窄等,翌圣借助ZymeEditor(点击了解更多)酶改造及发酵纯化工艺平台,对酶进行进化改造,及不断优化的反应体系,克服了酶切法建库方法学上的局限性,让酶切法建库更精准更快速!

 

 

 产品介绍 

Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3(Cat#12194)

 

Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3 是一款可用于Illumina®和MGI®高通量测序平台的新一代酶切法建库试剂盒。本试剂盒将片段化模块与末端修复模块合二为一,极大的降低了建库的时间和成本、连接模块的酶和buffer预混,简化了操作流程,更加适合于自动化建库。

 

 

 

实验原理

 

产品优势

  

高效稳定的片段化效果

  

以不同质量等级的FFPE DNA样本建库,样本投入量100 ng,采用同一酶切条件4℃ 1 min,37℃10 min,72℃ 20 min,4℃ hold,文库主峰在300 bp左右;数据显示不同降解程度的FFPE样本同一酶切条件下,文库主峰基本一致

 

FFPE DNA质量等级

A

B

C

D

文库产量(ng)

2550

2470

1760

1790

文库主峰(bp)

295bp

301bp

288bp

278bp

 

高效稳定的片段化效果

  

Human gDNA为模板,以不同的样本投入量,12194与竞品W试剂盒相比,12194的文库产量与竞品相当。数据显示不同投入量文库产量对比,12194有高效的文库转化效率

 

极低的假阳性率

  

NGS建库引入的假阳性问题主要包括嵌合序列和碱基错掺等因素,在酶切法片段化时将会引入一些假的嵌合序列,12194对片段化酶全面升级,解决了酶切假阳性的痛点。

 

用12194酶法片段化建库试剂盒对3种标准品样本(FFPE标准品、gDNA标准品、ctDNA标准品)建库,并和竞品W进行了头对头的比较。数据显示,无论是FFPE样本、gDNA、还是ctDNA,12194的Soft Clip、false chimeric都低于或近似于竞品W

 

优异的位点检出率

  

用12194和竞品W建库杂交捕获测序对比,模板类型为肿瘤SNV 5% gDNA标准品GW-OGTM006和肿瘤gDNA野生型标准品GW-OGTM005,将突变位点稀释为 0.5% 和0.1%,模板投入量100ng,PCR扩增循环数为7,捕获panel为何因Cancer SLC Panel,平均测序深度为5000×,比较捕获测序数据。数据显示12194对突变位点检出率与目标检出率一致。

 

产品订购指南

 

产品名称

产品货号

产品规格

Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3一步法DNA建库试剂盒V3

12194ES08

8 T

12194ES24

24 T

12194ES96

96 T

 

 

 

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产品应用

产品名称

产品编号

FFPE提取

MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit 磁珠法FFPE DNA提取试剂盒V2

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13577ES

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Hieff NGS® FFPE DNA Repair Reagent

12606ES

 

欢迎大家根据自己的实验需要进行测试和订购。如果对产品有疑问或是测试结果的反馈,可联系对应区域内的技术支持或销售同事,会为您提供专业的支持和服务。

 

 

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